Desde sus inicios, la proyección y las relaciones exteriores se han definido como una de las principales señas de identidad de la CRUE, con Europa e Iberoamérica como pilares fundamentales de su política de internacionalización, una política que gradualmente continúa ampliándose hacia otras regiones del mundo.

La CRUE ha sido de hecho protagonista destacada en los procesos de asociacionismo universitario que han llevado a la creación, en el contexto europeo, de la European University Association (EUA), y, en el ámbito iberoamericano, del Consejo Universitario Iberoamericano (CUIB). También forma parte de la organización internacional universitaria auspiciada por la UNESCO, la IAU. Asimismo, el papel de la CRUE ha sido primordial en el engarce de la relación entre ambas organizaciones.

La actividad de la CRUE en el escenario internacional está orientada a:

Asegurar una presencia constante de las universidades españolas en los principales foros universitarios internacionales, especialmente en la EUA y en el CUIB

Fomentar el diálogo con Conferencias de Rectores de otros países

Impulsar los procesos de convergencia universitaria

Participar activamente en la creación del Espacio Europeo de  Educación Superior (EEES), así como en la construcción del Espacio Iberoamericano del Conocimiento (EIC)

Promover la movilidad y los intercambios con otras regiones.

En todo este proceso ha sido de vital importancia la labor desarrollada por la Comisión  de Internacionalización y Cooperación de las Universidades Españolas (CICUE), una de las comisiones sectoriales de la CRUE, que mediante un gran número de iniciativas, proyectos y actividades ha ido llevando a la práctica las líneas de acción definidas por la CRUE en el espacio internacional.