La Secretaría General de Crue Universidades Españolas canaliza y sostiene la actividad ordinaria de la organización y da soporte a la Asamblea General, al Comité Permanente y a la Presidencia.
Asimismo, se encarga de gestionar la actividad y proyectos de las comisiones sectoriales y otras estructuras de apoyo a la organización.
Además, la Secretaría General dirige y coordina diferentes tipos de actos y eventos y presta servicio a las universidades miembros de la institución, con el fin de promover y defender los intereses de las universidades españolas.
Servicios Gestionados:
| Comunicación Información Relevante | Coordinación Política Universitaria |
| Programas Becas y Movilidad | Relación Medios de Comunicación y Stakeholders |
| Promoción Convenios y Acuerdos | Coordinación Nueve Comisiones Sectoriales |
| Organización Jornadas, Actos y Eventos | Elaboración Informes y Estudios |
| Interlocución Ante las AAPP | Relaciones Institucionales e Internacionales |
Áreas de Organización Interna:
